En el año 2004 se inicia la fusión de las escuelas en instituciones educativas, dándose inicialmente con la Inmaculada, Isaías Gamboa siendo director el Sr Nelson Quiñonez y luego la José Celestino Mutis siendo rector el Lic. Javier Bustos.

El primer rector de la fusión fue el Lic. Miguel Enrique Morales.

Los maestros en un principio fueron nombrados por el departamento y luego pasaron a formar parte de la nómina del municipio a partir del 2003. Quedando maestros municipales y municipalizados.

En un principio la escuela funcionaba solo con básica primaria, luego de la fusión empieza bachillerato hacia el año 2.004, un laboratorio de básica secundaria, los cuales funcionaban en la gran mayoría con maestros nombrados en provisionalidad. En el concurso de méritos docentes, se renueva la planta docente y se da continuidad a la formación de la media, siendo la modalidad BACHILLERATO BÁSICO.

En el año 2.013 se lleva a cabo la graduación de la primera promoción de estudiantes de la JOSÉ CELESTINO MUTIS.